Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 KTN1-225ENST00000557267 291 ntTSL 35.47□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 22.7
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TARDBPQ13148 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.4□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.142e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 231.53■■■□□ 2.647e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.537e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 CALN1-205ENST00000431984 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.18□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.871e-12■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 518.14■□□□□ 0.491e-12■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-12■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 PPP2R2A-216ENST00000522150 573 ntTSL 55.7□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 PPP2R2A-219ENST00000523473 654 ntTSL 45.7□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.436e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.496e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.766e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-211ENST00000584541 563 ntTSL 417.46■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 AC004223.3-202ENST00000591723 676 ntTSL 516.56■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 AC004223.3-203ENST00000592181 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.72□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-204ENST00000414419 559 ntTSL 411.19□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-209ENST00000581265 596 ntTSL 410.88□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 RFFL-212ENST00000584655 4039 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 225.63■■□□□ 1.698e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.478e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 37.13□□□□□ -1.278e-8■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.799e-7■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 325.11■■□□□ 1.619e-7■■■■□ 22.6
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TARDBPQ13148 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 22.6
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TARDBPQ13148 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 22.6
TARDBPQ13148 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 22.6
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TARDBPQ13148 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 22.5
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TARDBPQ13148 AASDHPPT-205ENST00000534152 5145 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.973e-6■■■■□ 22.5
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TARDBPQ13148 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RHOBTB3-202ENST00000502541 693 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 22.5
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TARDBPQ13148 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 ABCC1-205ENST00000574224 1543 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BUB1-211ENST00000490632 755 ntTSL 28.57□□□□□ -1.042e-10■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 GGNBP2-217ENST00000619573 2281 ntTSL 25.35□□□□□ -1.556e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 414.04□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RBM41-208ENST00000495517 3315 ntTSL 26.2□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 RBM41-203ENST00000434854 680 ntTSL 55.26□□□□□ -1.571e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 213.84□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 517.41■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.5
TARDBPQ13148 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.556e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.796e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.816e-7■■■■□ 22.4
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