Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAF1AQ13111 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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