Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms