Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms