Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms