Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KDSRQ06136 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms