Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms