Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX3P78415 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX3P78415 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms