Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX6P78412 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX6P78412 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IRX6P78412 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IRX6P78412 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX6P78412 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX6P78412 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX6P78412 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms