Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNA1P78396 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms