Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTG1P63261 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms