Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA2P62736 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms