Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms