Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP9P55211 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP9P55211 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms