Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms