Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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