Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP98P52948 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP98P52948 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP98P52948 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms