Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2A1P52655 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms