Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A3P48751 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A3P48751 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms