Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCLCP48506 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCLCP48506 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLCP48506 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms