Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPAP38571 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPAP38571 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms