Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms