Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms