Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms