Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNB1P35222 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms