Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E2P29084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms