Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB2P29033 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB2P29033 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB2P29033 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms