Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms