Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms