Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APCP25054 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APCP25054 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APCP25054 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APCP25054 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCP25054 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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