Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms