Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASTP20810 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASTP20810 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASTP20810 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASTP20810 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASTP20810 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms