Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF3P20783 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTF3P20783 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms