Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL5P13501 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL5P13501 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL5P13501 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL5P13501 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL5P13501 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL5P13501 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL5P13501 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms