Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms