Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL11A1P12107 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms