Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEFHP12036 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFHP12036 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms