Protein–RNA interactions for Protein: P09132

SRP19, Signal recognition particle 19 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19P09132 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP19P09132 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP19P09132 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP19P09132 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP19P09132 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP19P09132 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms