Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms