Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFMP07197 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFMP07197 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEFMP07197 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEFMP07197 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEFMP07197 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFMP07197 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms