Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC1P02654 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms