Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms