Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DCTN3O75935 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms