Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP2O75604 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP2O75604 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP2O75604 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP2O75604 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP2O75604 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP2O75604 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP2O75604 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP2O75604 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms