Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms