Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms