Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPAG9O60271 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
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