Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX6O43752 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX6O43752 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX6O43752 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX6O43752 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX6O43752 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX6O43752 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX6O43752 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX6O43752 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms