Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATCO43716 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATCO43716 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms