Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRC1O43663 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRC1O43663 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRC1O43663 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms